L’ASBL est gérée par un Conseil d’Administration composé de 8 membres dont le secrétaire-trésorier qui est chargé de la gestion journalière.

 L’Assemblée générale est composée de l’ensemble des membres associés. Elle est présidée par le président du conseil d’administration. Chaque Pouvoir Organisateur dispose d’une seule voix.

L’équipe de la FELSI
Un chargé de mission pour les matières concernant le fondamental, le secondaire, le spécialisé et le supérieur.

Un  chargé de mission pour l'enseignement de promotion sociale et l’enseignement secondaire artistique à horaire réduit (E.S.A.H.R.)

Une conseillère pédagogique pour le fondamental.

Un conseiller pédagogique pour le spécialisé.

Deux employés qui travaillent au secrétariat.

Une personne chargée des dossiers dépendant du Secrétariat Permanent de la Commission de Concertation et du Conseil Supérieur de l'enseignement de promotion sociale.